rs2651899变异与北印度人群无先兆偏头痛风险相关
rs2651899 variant is associated with risk for migraine without
rs2651899变异与北印度人群无先兆偏头痛风险相关
DOI: https://doi.org/10.1007/s11033- 019- 04593- 1
摘要-总结 为进一步重复这些发现,我们选择了两个SNP:位于1p36.32染色体PRDM16基因的rs2651899和位于2q37.1染色体靠近TRPM8基因的rs10166942,以验证它们与北印度人群偏头痛的关联,因为此前对该人群这些变异的研究较少。
进行了单变量和多变量分析,以发现这些SNP的不同基因型和等位基因与偏头痛及其亚型的关联。
我们发现偏头痛患者与对照组在PRDM16 rs2651899多态性方面存在统计学显著差异,在基因型水平(p < 0.05)、等位基因水平(p = 0.022;OR 1.462;95% CI 1.058-2.022)和显性模型(p = 0.011;OR 1.957;95% CI 1.169-3.276)均显著。
rs2651899变异在无先兆偏头痛(MO)亚组和女性亚组中也呈现类似趋势。
对于另一个SNP(rs10166942),偏头痛患者和对照之间的等位基因/基因型频率未报告统计学显著差异(p > 0.05)。
在亚组分析中,我们在伴先兆偏头痛(MA)和男性亚组与对照组整体之间发现基因型水平(p < 0.05)和显性模型存在统计学显著差异。
本研究表明,rs2651899在基因型和等位基因水平上是北印度人群MO和女性亚组偏头痛易感性的潜在遗传标志物,并发现rs10166942变异可能是MA和男性亚组的潜在标志物。
补充:这些发现加强了这些变异与偏头痛病理的先前关联,并为偏头痛机制和药物治疗提供了新的靶点。
引言 偏头痛全基因组关联研究(GWAS)揭示了LRP1、TRPM8和PRDM16基因中或附近的三个SNP[65]。
了解心血管疾病与偏头痛之间的共病关系,PRDM16基因可作为未来研究的候选标志物[118]。需要来自不同地理区域的合理样本量的更多病例对照研究来探索该SNP与偏头痛的关系。
由于偏头痛和神经病理性疼痛有某些相似特征[119],研究TRPM8基因在偏头痛中的作用以及这两种疼痛综合征之间的联系可能成为研究人员的有趣课题。
我们调查了两个SNP,即rs2651899和rs10166942,与北印度人群偏头痛患者和健康对照之间关联的研究。
材料与方法 我们从ESIC医学院及医院(法里达巴德)选择了150名无血缘关系的偏头痛受试者(43名MA和107名MO)。
排除患有神经系统疾病、共病和非偏头痛性头痛的受试者。
我们获得了所有受试者的书面知情同意,本研究获得JMI新德里和ESIC医学院及医院法里达巴德伦理委员会批准。
然后将该混合物分别在37°C用AvaI和65°C用MseI过夜孵育。消化的PCR产物在溴化乙锭染色的3%琼脂糖凝胶上检测。
rs2651899的273 bp PCR产物被AvaI酶消化为192 bp和81 bp(T等位基因),rs10166942的180 bp PCR产物被MseI酶在65°C下切割为107 bp和73 bp片段(T等位基因)。
结果 我们未能发现偏头痛患者和健康对照之间年龄方面的统计学差异(p = 0.35)。
我们发现偏头痛患者与对照组在PRDM16 rs2651899基因多态性方面存在统计学显著差异:基因型水平(p < 0.05)、等位基因水平(p = 0.022;OR 1.462;95% CI 1.058-2.022)和显性模型(p = 0.011;OR 1.957;95% CI 1.169-3.276)。
该多态性的性别分析结果显示,女性偏头痛患者与对照整体比较在基因型水平(p < 0.05)、等位基因水平(p = 0.009;OR 0.625;95% CI 0.440-0.889)和显性模型(p = 0.017;OR 0.498;95% CI 0.282-0.881)均有统计学显著差异。
在rs10166942各水平上,女性亚组与对照组整体比较未发现统计学显著差异(p > 0.05)。
讨论 他们研究中没有任何SNP特异性地与偏头痛亚型和特征相关,这与我们的结果矛盾,因为我们在MO和女性中发现了基因型和等位基因水平的统计学显著差异。
An等[120]报告了rs2658199变异在中国MO偏头痛易感性中的潜在作用,并发现该SNP等位基因分布中无先兆偏头痛(MO)与对照组存在显著差异(p = 0.049)。
对于变异rs10166942,我们在与对照比较的基因型和等位基因水平上未发现与偏头痛的关联(p > 0.05),但在亚组分析中在MA和男性亚组中发现基因型水平存在统计学显著差异(p < 0.05)。
Fan等[121]和An等[120]在两项不同研究中重复了SNP rs10166942,他们也报告了偏头痛患者和对照之间等位基因或基因型频率无统计学意义差异,进一步支持了我们的研究。
结论 我们重复验证了两个变异(即rs2658199和rs10166942)与来自北印度人群的偏头痛患者(包括伴先兆和无先兆偏头痛)的关联,发现rs2658199变异与无先兆偏头痛和女性亚组显著相关。
我们还报告了rs10166942变异可能是MA和男性亚组的潜在标志物。
致谢 基于Kaur, Sukhvinder; Ali, Arif; Ahmad, Uzair; Pandey, A. K.; Singh, Balkirat 2019年发表于Molecular Biology Reports的论文生成的机器摘要。